如果你发现公司扣除的底薪超过了法律规定的25%限制，这可能构成对劳动者权益的侵害。根据《劳动法》的相关规定，公司不得随意克扣员工工资，且扣除比例有明确上限。你可以首先与公司人力资源部门沟通，要求合理解释并纠正。若沟通无果，你可以向当地劳动监察部门投诉，或寻求劳动仲裁委员会的仲裁，甚至提起劳动诉讼来维护自己的合法权益。
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面对急辞扣底薪问题，操作如下：若公司扣除底薪合法合规（不超过25%），你需接受并办理离职手续；若公司扣除底薪超过法定限制，先与公司沟通协商，要求调整；协商不成，向劳动监察部门举报或申请劳动仲裁；必要时，准备证据材料提起诉讼。
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从法律角度看，公司不能单方面随意决定急辞扣底薪的标准。根据劳动法规定，扣除工资需有合法依据且不得超出法定限制（即不超过工资的25%）。公司单方面决定的扣除标准若违反此规定，则无效。劳动者有权要求公司遵守法律规定，维护自身合法权益。